Анализ генома показывает, что коронавирус может быть «химерой» двух разных вирусов

Ученый Университета Сорбонны, а также Института эволюции и биоразнообразия в своем интервью The Conversation приводит последние данные по анализу генома коронавируса.

Научный сотрудник Александр Хасанин считает, что новый коронавирус произошел от двух разных видов вирусов, которые могли объединиться.

В истории происхождения SARS-CoV-2 все еще много белых пятен. Молекулярный анализ, основанный на геномных последовательностях SARS-CoV-2, указывает на то, что он возник в ноябре 2019 года. Также известно, что в декабре 2019 года 27 из первых 41 госпитализированных (66%) побывали на рынке, расположенном в центре города Ухань в провинции Хубэй. Но, согласно исследованию, проведенному в Уханьской больнице, человек, которого можно назвать первым заболевшим, не посещал этот рынок. Это поднимает вопросы о связи между пандемией COVID-19 и дикой природой.

Геномные данные

Геном коронавируса SARS-CoV-2 был быстро секвенирован китайскими исследователями. Это молекула РНК, состоящая примерно из 30000 оснований, содержащая 15 генов, в том числе ген S, который кодирует белок, расположенный на поверхности вирусной оболочки. Для сравнения, наш геном в форме двойной спирали ДНК имеет около 3 миллиардов оснований и содержит около 30000 генов.

Сравнительный геномный анализ показал, что SARS-CoV-2 относится к группе бета-коронавирусов и что он очень близок к SARS-CoV, вызвавшему эпидемию острой пневмонии (SARS), которая возникла в ноябре 2002 года в китайской провинции Гуандун и распространилась на 29 стран в 2003 году. Всего в то время было зарегистрировано 8098 случаев SARS, в том числе 774 летальных.

С тех пор многие бета-коронавирусы были обнаружены, главным образом, у летучих мышей, хотя и у людей тоже. Например, RaTG13, обнаруженный у летучей мыши вида Rhinolophus affinis из китайской провинции Юнань, недавно был описан как очень похожий на SARS-CoV-2 – их последовательность генома идентична на 96%.  

Механизм рекомбинации

7 февраля 2020 года ученые узнали, что в панголине (чешуйчатый ящер) был обнаружен другой вирус, тоже близкий к SARS-CoV-2. Дальнейшие исследования показали, что вирус, выделенный из ящера, не несет ответственности за эпидемию COVID-19. Однако коронавирус, выделенный из панголина, оказался на 99% сходен с SARS-CoV-2 в конкретной области белка S, который позволяет вирусу проникать в человеческие клетки, чтобы заразить их.

В отличие от этого, вирус, выделенный из летучих мышей, имеет только 77% сходства. Это означает, что коронавирус, выделенный из панголина, способен проникать в клетки человека, тогда как коронавирус, выделенный из летучей мыши R. affinis, не способен.

Эти геномные сравнения показывают, что вирус SARS-Cov-2 является результатом комбинации двух различных вирусов, один из которых близок к вирусу летучей мыши, а другой – к вирусу панголина. Другими словами, новый коронавирус ­– это химера, образованная двумя ранее существовавшими вирусами.

Важно знать, что рекомбинация приводит к появлению нового вируса, потенциально способного инфицировать новый вид хозяина. Чтобы это случилось, два вируса должны были одновременно инфицировать один и тот же организм.

Два вопроса пока остаются без ответа. В каком организме произошла эта рекомбинация (летучая мышь, ящер или другой вид)? И при каких условиях? Исследования продолжаются.

Подробнее

Мнение специалиста

Подпишитесь на еженедельную рассылку наших новостей

Читают также

Случайная статья

Нежелание вставать по утрам может быть признаком серьезного расстройства
Заставлять себя покидать теплую постель бывает очень непросто. Обычно эту слабость списывают на недостаток сна или лень, но она также может быть симптомом серьезного расстройства, известного как ...
[ читать далее ]
Загрузка...
Load next
Facebook Twitter Telegram