Аналіз генома показує, що коронавірус може бути «химерою» двох різних вірусів

Вчений Університету Сорбонна, а також Інституту еволюції та біорізноманіття у своєму інтерв'ю The Conversation наводить останні дані з аналізу генома коронавірусу.

Науковий співробітник Александр Хасанін вважає, що новий коронавірус походить від двох різних видів вірусів, які могли об'єднатися.

У історії походження SARS-CoV-2 все ще багато білих плям. Молекулярний аналіз, заснований на геномних послідовностях SARS-CoV-2, вказує на те, що він виник у листопаді 2019 року. Також відомо, що у грудні 2019 року 27 з перших 41 госпіталізованих (66%) побували на ринку, розташованому в центрі міста Ухань у провінції Хубей. Але, згідно з дослідженням, проведеним в Уханьській лікарні, чоловік, якого можна назвати першим хворим, не відвідував цього ринку. Це порушує питання про зв'язок між пандемією COVID-19 і дикою природою.

Геномні дані

Геном коронавірусу SARS-CoV-2 був швидко секвенований китайськими дослідниками. Це молекула РНК, що складається приблизно з 30000 основ, вона містить 15 генів, у тому числі ген S, який кодує білок, розташований на поверхні вірусної оболонки. Для порівняння, наш геном у формі подвійної спіралі ДНК має близько 3 мільярдів основ і містить близько 30000 генів.

Порівняльний геномний аналіз показав, що SARS-CoV-2 відноситься до групи бета-коронавірусів і що він дуже близький до SARS-CoV, який викликав епідемію гострої пневмонії (SARS), що виникла в листопаді 2002 року в китайській провінції Гуандун і поширилася на 29 країн 2003 року. Всього на той час було зареєстровано 8098 випадків SARS, у тому числі 774 летальних.

Відтоді багато бета-коронавірусів були виявлені переважно у кажанів, хоча і у людей теж. Наприклад, RaTG13, виявлений у кажана виду Rhinolophus affinis з китайської провінції Юнань, нещодавно був описаний як дуже схожий на SARS-CoV-2 – їх послідовність генома ідентична на 96%.

Механізм рекомбінації

7 лютого 2020 року вчені дізналися, що у панголіна (лускатий ящір) було виявлено інший вірус, теж близький до SARS-CoV-2. Подальші дослідження показали, що вірус, виділений з ящера, не несе відповідальності за епідемію COVID-19. Однак коронавірус, виділений з панголіна, виявився на 99% схожий з SARS-CoV-2 у конкретній ділянці білка S, який дозволяє вірусу проникати в людські клітини, щоб заразити їх.

На відміну від цього вірус, виділений з кажанів, має тільки 77% схожості. Це означає, що коронавірус, виділений з панголіна, здатний проникати у клітини людини, тоді як коронавірус, виділений з кажана R. affinis, не здатний.

Ці геномні порівняння показують, що вірус SARS-Cov-2 є результатом комбінації двох різних вірусів, один з яких близький до вірусу кажана, а інший – до вірусу панголіна. Іншими словами, новий коронавірус – це химера, утворена двома вірусами, що раніше існували.

Важливо знати, що рекомбінація призводить до появи нового вірусу, потенційно здатного інфікувати новий вид господаря. Щоб це сталося, два віруси мали одночасно інфікувати один і той же організм.

Два запитання поки залишаються без відповіді. В якому організмі сталася ця рекомбінація (кажан, ящір або інший вид)? І за яких умов? Дослідження тривають.

Читати далі
telegram

Мнение специалиста

Підпишіться на щотижневу розсилку наших новин

Також читають

ВИПАДКОВА СТАТТЯ

Коли кашель може бути смертельно небезпечний
Задишка, часті бронхіти, постійний кашель можуть свідчити про небезпечне хронічне захворювання! За даними ВООЗ, хронічним обструктивним захворюванням легень (ХОЗЛ) страждає понад 251 мільйона людей ...
[ read more ]
Завантаження...
Load next
Facebook Twitter Telegram