14.05.2019

Метод «жидкой биопсии» позволяет выявить рак на самых ранних стадиях

Развитие технологий позволяет ученым все точнее обнаруживать начальные признаки рака и других проблем со здоровьем в образцах крови и мочи пациентов. Теперь стало возможным использовать «жидкую биопсию» для диагностики, которая менее травматична, чем традиционная, и предоставляет информацию о состоянии всего организма, а не отдельных органов..

Исследователи из онкологического центра Рогеля университета Мичигана разработали новый метод сканирования генетических отпечатков крошечных фрагментов РНК, обнаруженных в плазме крови, которые невидимы для традиционных методов секвенирования РНК. Результаты исследования опубликованы в журнале EMBO Journal, там же демонстрируется эффективность нового метода в исследовании пациентов с трансплантацией костного мозга.

Транспортно-матричная РНК и длинные некодирующие РНК дают полное представление о состоянии генов по всему организму, включая гены, которые активны только в определенных органах или связаны с конкретными заболеваниями, такими как рак. Таким образом, они могут служить потенциальными биомаркерами для распознания множества болезней.

Настоящим прорывом стало обнаружение микроРНК в плазме крови. «До этого эти типы РНК пропускались, потому что они имеют критические различия, которые не позволяли им проявляться в традиционных результатах секвенирования плазмы крови», – объясняет руководитель исследования, доктор медицинских наук и биомедицинской инженерии Муниш Тевари. Ученые использовали фермент, который сделал «видимой» всю последовательность микроРНК. И этот относительно простой шаг показал, что в крови есть тысячи дополнительных участков генов.

Второй важной частью исследования была разработка метода надежной обработки данных секвенирования для обеспечения точного результата – то, что ученые называют «конвейером биоинформатического анализа высокой строгости».

«Мы должны были выяснить, как отделить сигнал от шума: как удалить фрагменты нерелевантного генетического материала из бактериальных и вирусных РНК, а также из нашего собственного генома, которые добавляют шум к данным», – объясняет ученый.

Новый метод, названный phospho-RNA-seq, был протестирован в реальных условиях на образцах плазмы, взятых у пациентов, перенесших трансплантацию костного мозга. «Мы могли отслеживать маркеры восстановления их костного мозга после трансплантации, а также изменения в РНК плазмы крови, которые указывали на повреждение печени. Это же было подтверждено другими анализами», – говорит Тевари.

Phospho-RNA-seq имеет большое значение для дальнейших научных открытий, а также для клинического применения.

Теперь, когда стало известно, что тысячи ранее неисследованных РНК-фрагментов присутствуют в кровотоке, возник вопрос: почему они там находятся, и какие у них функции? Кроме того, новый метод дает возможность по образцу плазмы составить полную информацию о состоянии здоровья и заболеваниях пациента.

Доктор Тевари также подчеркнул важность совместной междисциплинарной работы, которая потребовала лабораторных, вычислительных и клинических знаний.

Читати далі
telegram

Мнение специалиста

Підпишіться на щотижневу розсилку наших новин

Також читають

ВИПАДКОВА СТАТТЯ

Як спосіб народження дитини впливає на її майбутнє здоров'я
Те, як дитина народжується, має глибокий вплив на її мікробіом. Діти, народжені природним шляхом, мають мікроби, відмінні від тих, які були отримані при кесаревому розтині. Дослідження показало, що ...
[ read more ]
Завантаження...
Load next
Facebook Twitter Telegram